अनुभाग-1 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• विश्‍वविद्यालयों की स्थापना प्रशासन सेवायें, अधिष्ठान परीक्षायें, प्रवेश।
• विश्‍वविद्यालयों अधिनियम परिनियम अध्यादेश तथा उनसे सम्बन्धित समस्त विधायी कार्य।
• राज्य उच्च शिक्षा परिषद एवं सामान्य परिषद से सम्बन्धित कार्य।
• विश्‍वविद्यालय जांच आयोग की स्थापना तथा उनकी संस्तुतियों का कार्यान्वयन।
• उपयुक्त विषयों से सम्बन्धित आडिट आपत्तियों के प्रकरण।
• उपयुक्त विषयों पर माननीय मुख्यम़ंत्री जी की घोषणाएं।
• उपयुक्त विषयों से सम्बन्धित संसद/विधान मण्डल से सम्बन्धित समस्त प्रकरण।
• केन्द्रीय सेवा के अधिकारियों/कर्मचारियों का अधिष्ठान कार्य।
• सम्पूर्णानन्द संस्कृत विश्‍वविद्यालय से सम्बद्ध महाविद्यालयों से सम्बन्धित समस्त कार्य।
  बजट एवं अधिष्ठान संस्कृत शिक्षा अनुभाग से व्यवहत होता है।

अनुभाग-2 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• मेरठ विश्‍वविद्यालय, रूहेलखण्ड विश्‍वविद्यालय बरेली, डा० भीम राव अम्बेडकर विश्‍वविद्यालय आगरा, बुन्देलखण्ड विश्‍वविद्यालय झांसी से सम्बद्ध अशासकीय महाविद्यालयों से सम्बन्धित निम्नलिखित कार्य-
• नये अशासकीय महाविद्यालय की स्थापना तथा उच्चीकरण।
• अशासकीय महाविद्यालय के सम्बद्धता के प्रकरण।
• वर्तमान स्नातक/स्नातकोत्तर महाविद्यालय में अतिरिक्त नये विषय तथा संकाय हेतु अस्थायी/स्थायी सम्बद्धता।
• वेतन संदाय के फलस्वरूप वेतन भुगतान।
• सम्बन्धित महाविद्यालय के अनियमितताओं के प्रकरण तथा प्राधिकृत नियंत्रक की नियुक्ति।
• शिक्षक/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों की नियुक्ति/सेवा सम्बन्धी प्रकरण।
• अशासकीय महाविद्यालयों का प्रान्तीयकरण।
• स्वायत्तशाषी महाविद्यालय की स्थापना।
• अशासकीय महाविद्यालयों से सम्बन्धित वादों के प्रकरण।
• शिक्षा एवं शिक्षणेत्तर कर्मचारियों के सेवा निवृत्तिक लाभों के प्रकरण।
• तदर्थ प्रवक्ताओं का विनियमितीकरण।
• नीति विषयक समस्त प्रकरण।
• अखिल भारतीय तकनीकी शिक्षा परिषद क्षेत्रान्तर्गत प्रबन्धकीय पाठ्यक्रमों को संचालित करने वाली संस्थाओं की स्थापना।
• अशासकीय महाविद्यालयों के शिक्षक/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों के वेतनमान पुनरीक्षण तथा यू०जी०सी० से सम्बन्धित वेतनमान प्रकरण।
• अशासकीय महाविद्यालय से सम्बन्धित संगठनों के भागों के प्रकरण।
• शुल्कों तथा मानकों का निर्धारण।
• अशासकीय महाविद्यालयों से सम्बन्धित संगठनों के भागों के प्रकरण।
• स्नातक/स्नातकोत्तर बी०एड० तथा कृषि कक्षा में प्रवेश नियमावली।
• त्रिवर्षीय पाठ्यक्रम का कार्यान्वयन।
• उत्तर प्रदेश उच्चतर शिक्षा सेवा आयोग से सम्बन्धित कार्य।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित आडिट आपत्तियों से सम्बन्धित प्रकरण।
• उपर्युक्त विषयों पर मा० मुख्यमंत्री जी की घोषणा।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित संसद/विधान मण्डल की सूचनाएं तथा प्रश्‍न आदि।

अनुभाग-3 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• शाखा अधिष्ठान सम्बन्धी समस्त कार्य।
• विदेशों में सम्मेलन हेतु यात्रानुदान।
• विदेश जाने वाले छात्रों को यात्रानुदान।
• प्रोटोकाल विभाग से प्राप्त होने वाले समस्त मामलों एवं प्रोटोकाल से सम्‍बन्धित समस्त कार्य।
• राष्ट्रीय छात्रवृत्ति
• वरिष्ठ प्रशासनिक अधिकारियों का सम्मेलन (समन्वय कार्य)
• विधान सभा/विधान परिषद/आश्वासनों/मा० मुख्य मंत्री जी की घोषणाओं का समन्वय, लोक शिकायत प्रकरण से सम्बन्धित समस्त कार्य। न्यायालय में लम्बित प्रकरणों का समन्वय राष्ट्रीय एकीकरण, अनुसूचित जातियों/जनजातियों/पिछड़े वर्गों आदि की सेवाओं में आरक्षण सम्बन्धी समन्वय एवं अनुश्रवण कार्य। विलम्ब समिति एवं राज्यपाल की घोषणाओं का समन्वय कार्य। सूचना का अधिकार अधिनियम-2005 के संबंध में प्राप्त निर्देशों पर कार्यवाही मानवाधिकार आयोग प्रकरणों का समन्वय कार्य विधान सभा/विधान परिषद की समितियों संबंधी समन्वय कार्य नियम 301/115 के अंतर्गत प्राप्त सूचनाओं का समन्वय कार्य। विधान मंडल सत्र के दौरान संसदीय कार्य/मुख्यमंत्री कार्यालय से प्राप्त निर्देशों पर कार्यवाही। महामहिम श्री राज्यपाल के अभिभाषण संबंधी सूचना तैयार करना वृक्षारोपध के संबंध में समन्वय कार्य।

अनुभाग-4 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• विश्‍वविद्यालय के आय-व्ययक, आडिट, भूमि अर्जन, विकास अनुदान, पदों की स्वीकृति, छात्र आन्दोलन, आयोजनाएं , कला एवं शिल्प महाविद्यालय आदि।
• उच्च शिक्षा सम्बन्धित समस्त आयोजनागत/आयोजनेत्तर/बजट/प्लान/परिव्यय का समन्वय, अनुश्रवण, समीक्षा, वित्त आयोग, लोक लेखा समिति, प्राक्कलन समिति का समन्वय कार्य।
• दयाल बाग डीम्ड विश्‍वविद्यालय आगरा।
• विश्वविद्यालयों में पद सृजन/सत्तीकरण/स्थलीकरण/वेतन विसंगति।
• उपयुक्त विषयों से सम्बन्धित आडिट आपत्तियों का प्रकरण।
• उपर्युक्त विषयों पर मा० मुख्यमंत्री जी की घोषणाएं ।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित संसद/विधान मण्डल से सम्बन्धित समस्त प्रकरण।

अनुभाग-5 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• उच्च शिक्षा निदेशालय के अधिकारियों कर्मचारियों के सेवा सम्बन्धी समस्त मामले/ अधिष्ठान कार्य/बजट
• क्षेत्रीय कार्यालय/शिविर कार्यालय की स्थापना बजट सम्बन्धी समस्त कार्य।
• राजकीय महाविद्यालयों की स्थापना संबंधी कार्य।
• राजकीय महाविद्यालयों के प्राचार्यों/प्रवक्ताओं/तृतीय/चतुर्थ श्रेणी कर्मचारियों के सेवा सम्बन्धी समस्त मामले।
• राजकीय महाविद्यालयों के भवन निर्माण कार्य/अनुरक्षण कार्य।
• प्राचार्यों/प्रवक्ताओं का प्रशिक्षण सम्बन्धी नीति विषयक कार्य।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित आडिट आपत्तियों के प्रकरण।
• उपर्युक्त विषय पर मा० मुख्यमंत्री जी की घोषणाएं ।
• उपर्युक्त विषयों पर मा० संसद/विधान मण्डल की सूचनाएं तथा प्रश्न आदि।

अनुभाग-6 के मुख्य कार्य इस प्रकार हैं:

• लखनऊ विश्व‍विद्यालय, डा० राम मनोहर लोहिया अवध विश्वविद्यालय अयोध्या, पूर्वांचल विश्वविद्यालय जौनपुर (वीर बहादुर विश्वविद्यालय), पं० दीन दयाल विश्वविद्यालय गोरखपुर, इलाहाबाद विश्वविद्यालय प्रयागराज, छत्रपति शाहू जी महाराज विश्वविद्यालय कानपुर से सम्बद्ध अशासकीय महाविद्यालयों से सम्बन्धित निम्नलिखित कार्य :-
• नये अशासकीय महाविद्यालयों की स्थापना तथा उच्चीकरण।
• अशासकीय महाविद्यालयों के सम्बद्धता के प्रकरण।
• अशासकीय महाविद्यालय में अतिरिक्त विषयक एवं संकाय हेतु अस्थायी/स्थायी सम्बद्धता।
• वेतन संदाय हेतु अस्थायी/स्थायी सम्बद्धता।
• वेतन संदाय के फलस्वरूप वेतन भुगतान।
• सम्बन्धित महाविद्यालयों के अनियमितताओं के प्रकरणों की जांच एवं प्राधिकृत नियंत्रकों की नियुक्ति।
• सम्बन्धित महाविद्यालयों को अल्पसंख्यक घोषित किया जाना।
• शिक्षक/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों की नियुक्ति/सेवा सम्बन्धी प्रकरण।
• अशासकीय महाविद्यालय का प्रान्तीयकरण।
• स्वायत्तशाषी महाविद्यालयों की स्थापना।
• शिक्षण/शिक्षणेत्तर पदों का सृजन।
• अशासकीय महाविद्यालयों से सम्बन्धित पदों के प्रकरण।
• शिक्षण/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों के सेवा निवृत्ति लाभों का प्रकरण।
• अशासकीय महाविद्यालय में शिक्षक/शिक्षणेत्तर पदों के सृजन से सम्बन्धित उच्च स्तरीय बैठक का आयोजन।
• अशासकीय महाविद्यालयों का बजट/बजट प्लान/योजनाएं तथा अनुरक्षण अनुदान।
• विश्वविद्यालय अनुदान आयोग द्वारा महाविद्यालयों को स्वीकृति अनुदान के प्रति मैचिंग सेयर। अशासकीय महाविद्यालयों को अनुदान सूची पर लिया जाना।
• अशासकीय महाविद्यालयों के शिक्षक/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों के पेंशन सम्बन्धी नीति विषयक मामले।
• राज्य विश्वविद्यालय/अशासकीय विद्यालय पेंशनर कल्याण समिति के कार्य।
• शिक्षक/शिक्षणेत्तर कर्मचारियों के पदों का सततीकरण।
• अल्पसंख्यक संस्थाओं से सम्बन्धित कार्य।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित आडिट आपत्तियों के प्रकरण।
• उपर्युक्त विषयों से सम्बन्धित मा० मुख्य मंत्री जी की घोषणाएं /संसद/विधान मण्डल की सूचनाएं तथा प्रश्न आदि।

• असेवित क्षेत्र में खुलने वाले अशासकीय महाविद्यालयों को अनुदान।